阻碍前进的怪物
「格纳尔太阳系」中居住着许多远比一般人类身形巨大的原生生物。对于居住在太阳系的人类来说，他们既是共存者，也是生活上的威胁者。从SEED来袭以来，各地都有原生生物凶暴化的报告传来。
不只原生生物，也可能会与被称为「机器人」的机械们，以及在守护者联盟中志向不同的人们战斗。
以上的这些对手以及在前进过程中遇到的SEED，都是阻挠守护者联盟前进的最大原因。 在这里介绍其中一些具有代表性的角色。
哥而·多而巴（GOL DOLVA）
栖息在帕尔姆行星上。是被用来作为食材，可食用的原生生物，亦是名为「帕尔姆特产」的原生生物哥尔多巴的大型种。平时饲养在牧场中，身长可达5m。头脑不是很好，擅长身体冲撞或推挤攻击。
迪·拉肯（DE RAGAN）
栖息在帕尔姆行星上，被称为「草原的支配者」的原生生物。个性凶暴，平时居住在高地上。由于ＳＥＥＤ骚动，从高处来到了地面。口中吐出的高热气息以及火球，让被侵袭的人陷入恐怖之中。
翁马哥库（ONMAGOUG）
栖息在蒙多布行星骷骨沙漠的大型原生生物。体型虽大，但迅速的动作及强大的威力，带给玩家很大的威胁。
寇古·纳德（KOG NADD）
这种特征的关系，一旦被他碰到，会受到很严重的伤害。
格利纳·彼得（GRINNA BET）
军用大型机器人。 透过手臂上各种配件的调整，可以换上各种不同的武器配备。
比而·德·比亚（BIL DE VEAR）
栖息在蒙多布行星骷骨沙漠的大型原生生物。体型虽大，但迅速的动作及强大的威力，带给玩家很大的威胁。